Molecular Characterization of Secondary dormancy in the annual taxon Silene integripetala subsp. greuteri
My name is Manolis Perathorakis. I am from Chania, Crete. I am a biologist and at the present I am post graduate student in MAICH. My work focuses on the genetic basis of plant secondary dormancy.
My model plant is Silene integripetala subsp. greuteri, a small endemic threatened plant of Crete. I have conducted full scale germination tests under various conditions of light and temperature. Specifically, I studied germination under 5 different temperatures (5 οC, 10 οC, 15 οC, 20 οC, 24 οC) and under continuous darkness and under white light/dark (12 h/12 h). My studies included 3 different seed collections from cultivated plants (plant material collected in different time periods) in order to assess possible ‘mother effect’. At present I search for the most efficient RNA extraction protocol for the plant material. The aim is to sequence the RNA samples using high-throughput sequencing technologies (RNA-seq) and perform transcriptomics analysis.
Photo: Manolis Perathorakis in the Mediterranean Agronomic Institute Chania (Photo: MAICh)
Ονομάζομαι Μανώλης Περαθωράκης. Είμαι από τα Χάνια της Κρήτης, είμαι βιολόγος και αυτόν τον καιρό κάνω μεταπτυχιακές σπουδές στο ΜΑΙΧ. Εργάζομαι πάνω στη γενετική βάση του δευτερογενούς λήθαργου των φυτών.
Photo: Silene integripetala Bory & Haub. subsp. greuteri (Phitos) Akeroyd. Caryophyllaceae. (Photo: MPCU – MAICh)
Το φυτό που χρησιμοποιώ είναι το Silene integripetala subsp. greuteri, ένα μικρό ενδημικό απειλούμενο φυτό της Κρήτης. Διεξήγαγα ευρείας κλίμακας μελέτες φύτρωσης υπό διαφορετικές συνθήκες φωτός και θερμοκρασίας. Συγκεκριμένα, μελέτησα τη φύτρωση υπό την επίδραση 5 διαφορετικών θερμοκρασιών (5 οC, 10 οC, 15 οC, 20 οC, 24 οC) και σε συνεχές σκοτάδι και σε λευκό φως/σκοτάδι (12 h/12 h). Οι μελέτες μου έγιναν πάνω σε 3 διαφορετικές συλλογές από καλλιέργεια (φυτικό υλικό που είχε συλλεχθεί σε διαφορετική χρονική περίοδο) ώστε να παρατηρηθεί τυχόν ‘μητρική επίδραση’. Στην παρούσα φάση αναζητώ το καταλληλότερο πρωτόκολλο απομόνωσης RNA από το φυτικό υλικό των πειραμάτων μου. Σκοπός μου είναι να χρησιμοποιηθούν τα δείγματα αυτά για αλληλούχηση ευρείας κλίμακας (high throughput sequencing), ώστε να γίνει σύγκριση του μεταγραφικού προφίλ των διαφορετικών πειραμάτων.